Ergenekon operasyonu çerçevesinde gözaltına alınan YÖK eski Başkanı Prof. Dr. Kemal Gürüz'ün evine gelen CHP Genel Başkan Yardımcısı Yılmaz Ateş, İstanbul Milletvekili Nur Serter ve Ankara Milletvekili Nesrin Baytok, gazetecilere açıklamalarda bulundular. Ateş, Türkiye'nin bir polis devletine ve faşizme doğru yol aldığını öne sürerek, "Maalesef AKP iktidarı kendisine muhalif olan, kendi yanlışlarını kamuoyunda paylaşan, bunların yanlışlarını kamuoyunda dillendiren herkesin üzerinde Demoklesin kılıcı gibi bir Ergenekon kılıcını sallamaktadırlar. Bu kılıç döner kendilerini vurur." diye konuştu.
CHP İstanbul Milletvekili Nur Serter de Gürüz'ün uluslararası düzeyde çok önemli bir bilim adamı olduğuna işaret ederek, "Son derece üzgünüm. Türkiye'nin en değerli aydınları, bilim adamları ve komutanlarının bu biçimde gözaltına alınmaları ve ne olduğu belli olmayan Ergenekon iddiasıyla suçlanmaları Türkiye adına 21. yüzyılda utanç vericidir. Ben böyle bir ülkede yaşamaktan şu anda, şu olaylara tanık olduğum zaman utanç duyuyorum." yorumunda bulundu.